Discovering the Relevance of Gene Signature of Lung Cancer and Drugs
Article Sidebar
Published:
Aug 24, 2018
Keywords:
gene lung cancer drug oncogene gene signature probe
Main Article Content
Abstract
Both nationally and globally, Lung cancer is one of the common and the leading cause of death. The disease is caused by the malfunction of genes in the normal lung cells. Chemotherapy is one type of treatment used to control or inhibit or stop the carcinogenic activity of cancer cells. The relevance of gene signature lung cancer and drug will make it possible to prescribe current medications and discover the new drugs. This article presents how to find gene signatures of lung cancer. Also, how to find drugs that can control gene expression in those lung cancer cells. The purpose of this article is to suggest new drugs of lung cancer that may not have been discovered before. This is the information that the relevant people can take advantage of.
Article Details
How to Cite
[1]
สุทธหลวง เ. and คุรุบรรเจิดจิต น., “Discovering the Relevance of Gene Signature of Lung Cancer and Drugs”, NKRAFA J SCI TECH, vol. 13, no. 1, pp. 116–132, Aug. 2018.
Section
Academic Articles
- Content and information in articles published in NKRAFA Journal of Science and Technology are comment and responsibility of authors of articles directly. Journal editorial do no need to agree or share any responsibility.
- NKRAFA Journal of Science and Technology Articles holds the copyright of the content, pictures, images etc. which published in it. If any person or agency require to reuse all or some part of articles, the permission must be obtained from the NKRAFA Journal of Science and Technology.
References
[1] Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Sayan Mukherjee, Benjamin L. Ebert, Michael Gillette, Amanda Paulovich, Scott L. Pomeroy, Todd R. Golub, Eric S. Lander, and Jill P. Mesirov. Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. PNAS, 102:15545-15550, 2005. [Online]. Available: https://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb . [Accessed: July. 4, 2017].
[2] Ashbumer et al. Gene Ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nat Genet. The Gene Ontology Consortium, 25(1): 25-9, 2000. [Online]. Available: https://www.geneontology.org/page/download-annotations. [Accessed: October. 2, 2017].
[3] Justin Lamb, Emily D.Crawford, David Peck, Joshua W.Modell, Irene C. Blat, Matthew J.Wrobel, Jim Lerner, Jean-Philippe Brunet, Aravind Subramanian, Kenneth N. Ross, Michael Reich, Haley Hieronymus, Guo Wei, Scott A. Armstrong, Stephen J. Haggarty, Paul A. Clemons, Ru Wei, Steven A. Carr, Eric S. Lander and Todd R.Golub. The Connectivity Map: Using Gene-Expression Signatures to Connect Small Molecules, Genes, and Disease. Science , 313:1929-1935, 2006.
[4] สำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข กระทรวงสาธารณสุข, สถิติสาธารณสุข พ.ศ.2558 , กรุงเทพมหานคร:กระทรวงสาธารณสุข, 2559. [Online]. Available: https://bps.moph.go.th/new_bps/sites/default/files/health_statistic2558.pdf [Accessed: October. 1, 2017].
[5] นางสาวพรสุดา จิตรกสิกร, นิลทิดา ศรีพบูลย์กิจ. สถิติผู้ป่วยโรคมะเร็งปอด. หน่วยทะเบียนมะเร็ง คณะแพทย์ศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี, กรุงเทพมหานคร:โรงพยาบาลรามาธิบดี, 2560. [Online]. Available: https://med.mahidol.ac.th/cancer_center/th/news/event/22082016-1833-th [Accessed: October. 2, 2017].
[6] Anne S. Tsao. Lung Carcinoma (Lung Cancer). Merck Manual Professional Version. USA:Merck Sharp & Dohme Corp., 2017. [Online]. Available: https://www.merckmanuals.com/professional/pulmonary-disorders/tumors-of-the-lungs/lung-carcinoma#sec05-ch062-ch062b-1405 [Accessed: October. 2, 2017].
[7] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
[8] Karri Vasavi RAMA, MOLECULAR PROBES AND THEIR APPLICATIONS. International Journal of Life Sciences Biotechnology and Pharma Research. 2(2): 32-42, 2013. [Online]. Available: https://new.ijlbpr.com/jlbpradmin/upload/ijlbpr_51835623c403f.pdf [Accessed: July. 6, 2017].
[9] https://portals.broadinstitute.org/cmap/signature
[10] Justin Lamb, Emily D. Crawford, David Peck, Joshua W Modell, Irene C. Blat, Matthew J. Wrobel, Jim Lerner, Jean-Philippe Brunet, Aravind Subramanian, Kenneth N. Ross, Michael Reich, Haley Hieronymus, Guo Wei, Scott A Armstrong, Stephen J. Haggarty, Paul A. Clemons, Ru Wei, Steven A. Carr, Eric S. Lander and Todd R Golub. The Connectivity Map: Using Gene-Expression Signatures to Connect Small Molecules, Genes, and Disease. Nature Reviews Cancer, 7:54-60, 2007.
[11] V.Law, C.Knox, Y.Djoumbou, T.Jewison, AC.Guo, Y.Liu, A.Maciejewski, D.Arndt, M.Wilson, V.Neveu, A.Tang, G.Gabriel, C.Ly, S.Adamjee, ZT. Dame, B.Han, Y.Zhou and DS.Wishart. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Research. 42(Database issue): D1091-7, 2014. doi: 10.1093/nar/gkt1068.
[12] ปรีชา มนทกานติกุล, สุทธิพร ภัทรชยากุล. ยาต้านจุลชีพกลุ่มเซฟาโลสปอริน (Therapeutic Review of Cephalosperinns). สมาคมเภสัชกรรมโรงพยาบาล(ประเทศไทย).
กรุงเทพมหานคร:สมาคมเภสัชกรรมโรงพยาบาล(ประเทศไทย), 2006. [Online]. Available: https://www.thaihp.org/index.php?option=other_detail&lang=th&id=15&sub=26 [Accessed: July. 12, 2017].
[13] จริญญาพร เนาวบุตร. กลไกการออกฤทธิ์ของหม่อน (Morus alba Linn.) ในการต้านภาวะเบาหวานและป้องกันหลอดเลือดทํางานผิดปกติในหนูขาวที่เหนี่ยวนําให้เป็นเบาหวานด้วยสาร streptozotocin. วิทยานิพนธ์ปริญญาปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเภสัชวิทยา บัณฑิตวิทยาลัย มหาวิทยาลัยขอนแก่น ประเทศไทย, 2553.
[14] กวิญ ลีละวัฒน์. ผลของ Phosphorylation ของ signal transduction molecule ในการเพิ่มความไวของ oxaliplatin ในเซลล์มะเร็งทางเดินน้ำดี. งานศัลยศาสตร์ทั่วไป กลุ่มงานศัลยศาสตร์ โรงพยาบาลราชวิถี ประเทศไทย, 2551.
[15] M. Joseph Caster, Manish Sethi, Sonya Kowalczyk, Edina Wang, Xi Tian, Sayed Nabeel Hyder, Kyle T. Wagner, Ying-Ao Zhang, Chintan Kapadia, Kin Man Au, Andrew Z. Wang. Nanoparticle delivery of chemosensitizers improve chemotherapy efficacy without incurring additional toxicity. Nanoscale. 7(6): 2805–2811, 2015. doi: 10.1039/c4nr07102f
[16] กนกพร ธัญมณีสิน. บัญชีรายการยา รพ.สต. (ยาใช้ภายนอก) จ.ขอนแก่น. ในสภากาแฟเพื่อพัฒนาระบบยาชุมชนใน จ. ขอนแก่น, ขอนแก่น:โครงการพัฒนาระบบยาในหน่วยบริการปฐมภูมิและความปลอดภัยด้านยาในชุมชน, 2555.
[17] Valentin Fuster M.D., R. Wayne Alexander M.D., Robert A. O’Rourke. M.D. Hurst’s The Heart. 10th International edition. USA. McGRAW- HILL Medical publishing division, 2001.
[18] สำนักพัฒนาวิชาการแพทย์ กรมการแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข. แนวทางเวชปฏิบัติโรคลิ้นหัวใจพิการสำหรับโรงพยาบาลระดับปฐมภูมิ (Vulvular Heart Disease for Primary Medical Care). ชุมนุมสหกรณ์การเกษตรแห่งประเทศไทย จำกัด. ISBN : 974-442-127-5.
[19] ศูนย์ข้อมูลข่าวสาร กระทรวงสาธารณสุข
[20] เภสัชกร อภัย ราษฎรวิจิตร. หาหมอ.คอม
[21] Echizen H, Saima S, Umeda N, Ishizaki T. Altered protein binding of disopyramide in plasma from patients with cancer and with inflammatory disease. Therapeutic drug monitoring, 9(3)272-8, 1997.
[22] กลุ่มงานเภสัชกรรม โรงพยาบาลราชวิถี. เอกสารแนะนำผู้ป่วย. กรุงเทพมหานคร:โรงพยาบาลราชวิถี, 2547.
[23] Susan Budavari. The Merck index: an encyclopedia of chemicals, drugs, and biological, 11th Edition. Rahway N.J. U.S.A.: Merck & Co., 1989.
[24] อรุณี เดชาพันธุ์กุล, มนัญยา ชาครานนท์, สลิล ชัยวิริยะวงศ์และ ภัทรพิมพ์ สรรพวีรวงศ์. การรักษามะเร็งเต้านมโดยใช้ยาต้านฮอร์โมน. สงขลานครินทร์เวชสาร, 29 (3):127-142, 2554. [Online]. Available: https://medinfo.psu.ac.th/smj2/29_3/04-arunee.pdfhttps://medinfo.psu.ac.th/smj2/29_3/04-arunee.pdf [Accessed: July. 29, 2017].
[25] เภสัชกร ศิวัสว์ ผุลลาภิวัฒน์. หาหมอ.คอม
[26] สริน ทัดทอง. ฮีทช็อคโปรตีน 90 เป้าหมายในการรักษามะเร็ง Heat Shock Protein 90: Target for Cancer Therapy. Thai Pharmaceutical and Health Science Journal – วารสารไทยเภสัชศาสตร์และวิทยาการสุขภาพ, 11(4), 2016.
[27] AMA, Drug Evaluations Annual: 311, 1994.
[28] เอื้อมแข สุขประเสริฐ. CANCER THERAPY. หน่วยมะเร็งวิทยา ภาควิชาอายุรศาสตร์ คณะแพทย์ศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น. การประชุมเชิงปฏิบัติการและการฝึกอบรมเทคนิคการผสมยาเคมีบำบัดที่ให้ทางหลอดเลือดสำหรับเภสัชกรสาขาโรคมะเร็ง ประจำปี 2554 Workshop and Traineeship for Oncology Pharmacy Practitioners 2011. 21-25 กุมภาพันธ์ 2554. กรุงเทพมหานคร: 25-39, 2554.
[2] Ashbumer et al. Gene Ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nat Genet. The Gene Ontology Consortium, 25(1): 25-9, 2000. [Online]. Available: https://www.geneontology.org/page/download-annotations. [Accessed: October. 2, 2017].
[3] Justin Lamb, Emily D.Crawford, David Peck, Joshua W.Modell, Irene C. Blat, Matthew J.Wrobel, Jim Lerner, Jean-Philippe Brunet, Aravind Subramanian, Kenneth N. Ross, Michael Reich, Haley Hieronymus, Guo Wei, Scott A. Armstrong, Stephen J. Haggarty, Paul A. Clemons, Ru Wei, Steven A. Carr, Eric S. Lander and Todd R.Golub. The Connectivity Map: Using Gene-Expression Signatures to Connect Small Molecules, Genes, and Disease. Science , 313:1929-1935, 2006.
[4] สำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข กระทรวงสาธารณสุข, สถิติสาธารณสุข พ.ศ.2558 , กรุงเทพมหานคร:กระทรวงสาธารณสุข, 2559. [Online]. Available: https://bps.moph.go.th/new_bps/sites/default/files/health_statistic2558.pdf [Accessed: October. 1, 2017].
[5] นางสาวพรสุดา จิตรกสิกร, นิลทิดา ศรีพบูลย์กิจ. สถิติผู้ป่วยโรคมะเร็งปอด. หน่วยทะเบียนมะเร็ง คณะแพทย์ศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี, กรุงเทพมหานคร:โรงพยาบาลรามาธิบดี, 2560. [Online]. Available: https://med.mahidol.ac.th/cancer_center/th/news/event/22082016-1833-th [Accessed: October. 2, 2017].
[6] Anne S. Tsao. Lung Carcinoma (Lung Cancer). Merck Manual Professional Version. USA:Merck Sharp & Dohme Corp., 2017. [Online]. Available: https://www.merckmanuals.com/professional/pulmonary-disorders/tumors-of-the-lungs/lung-carcinoma#sec05-ch062-ch062b-1405 [Accessed: October. 2, 2017].
[7] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
[8] Karri Vasavi RAMA, MOLECULAR PROBES AND THEIR APPLICATIONS. International Journal of Life Sciences Biotechnology and Pharma Research. 2(2): 32-42, 2013. [Online]. Available: https://new.ijlbpr.com/jlbpradmin/upload/ijlbpr_51835623c403f.pdf [Accessed: July. 6, 2017].
[9] https://portals.broadinstitute.org/cmap/signature
[10] Justin Lamb, Emily D. Crawford, David Peck, Joshua W Modell, Irene C. Blat, Matthew J. Wrobel, Jim Lerner, Jean-Philippe Brunet, Aravind Subramanian, Kenneth N. Ross, Michael Reich, Haley Hieronymus, Guo Wei, Scott A Armstrong, Stephen J. Haggarty, Paul A. Clemons, Ru Wei, Steven A. Carr, Eric S. Lander and Todd R Golub. The Connectivity Map: Using Gene-Expression Signatures to Connect Small Molecules, Genes, and Disease. Nature Reviews Cancer, 7:54-60, 2007.
[11] V.Law, C.Knox, Y.Djoumbou, T.Jewison, AC.Guo, Y.Liu, A.Maciejewski, D.Arndt, M.Wilson, V.Neveu, A.Tang, G.Gabriel, C.Ly, S.Adamjee, ZT. Dame, B.Han, Y.Zhou and DS.Wishart. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Research. 42(Database issue): D1091-7, 2014. doi: 10.1093/nar/gkt1068.
[12] ปรีชา มนทกานติกุล, สุทธิพร ภัทรชยากุล. ยาต้านจุลชีพกลุ่มเซฟาโลสปอริน (Therapeutic Review of Cephalosperinns). สมาคมเภสัชกรรมโรงพยาบาล(ประเทศไทย).
กรุงเทพมหานคร:สมาคมเภสัชกรรมโรงพยาบาล(ประเทศไทย), 2006. [Online]. Available: https://www.thaihp.org/index.php?option=other_detail&lang=th&id=15&sub=26 [Accessed: July. 12, 2017].
[13] จริญญาพร เนาวบุตร. กลไกการออกฤทธิ์ของหม่อน (Morus alba Linn.) ในการต้านภาวะเบาหวานและป้องกันหลอดเลือดทํางานผิดปกติในหนูขาวที่เหนี่ยวนําให้เป็นเบาหวานด้วยสาร streptozotocin. วิทยานิพนธ์ปริญญาปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเภสัชวิทยา บัณฑิตวิทยาลัย มหาวิทยาลัยขอนแก่น ประเทศไทย, 2553.
[14] กวิญ ลีละวัฒน์. ผลของ Phosphorylation ของ signal transduction molecule ในการเพิ่มความไวของ oxaliplatin ในเซลล์มะเร็งทางเดินน้ำดี. งานศัลยศาสตร์ทั่วไป กลุ่มงานศัลยศาสตร์ โรงพยาบาลราชวิถี ประเทศไทย, 2551.
[15] M. Joseph Caster, Manish Sethi, Sonya Kowalczyk, Edina Wang, Xi Tian, Sayed Nabeel Hyder, Kyle T. Wagner, Ying-Ao Zhang, Chintan Kapadia, Kin Man Au, Andrew Z. Wang. Nanoparticle delivery of chemosensitizers improve chemotherapy efficacy without incurring additional toxicity. Nanoscale. 7(6): 2805–2811, 2015. doi: 10.1039/c4nr07102f
[16] กนกพร ธัญมณีสิน. บัญชีรายการยา รพ.สต. (ยาใช้ภายนอก) จ.ขอนแก่น. ในสภากาแฟเพื่อพัฒนาระบบยาชุมชนใน จ. ขอนแก่น, ขอนแก่น:โครงการพัฒนาระบบยาในหน่วยบริการปฐมภูมิและความปลอดภัยด้านยาในชุมชน, 2555.
[17] Valentin Fuster M.D., R. Wayne Alexander M.D., Robert A. O’Rourke. M.D. Hurst’s The Heart. 10th International edition. USA. McGRAW- HILL Medical publishing division, 2001.
[18] สำนักพัฒนาวิชาการแพทย์ กรมการแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข. แนวทางเวชปฏิบัติโรคลิ้นหัวใจพิการสำหรับโรงพยาบาลระดับปฐมภูมิ (Vulvular Heart Disease for Primary Medical Care). ชุมนุมสหกรณ์การเกษตรแห่งประเทศไทย จำกัด. ISBN : 974-442-127-5.
[19] ศูนย์ข้อมูลข่าวสาร กระทรวงสาธารณสุข
[20] เภสัชกร อภัย ราษฎรวิจิตร. หาหมอ.คอม
[21] Echizen H, Saima S, Umeda N, Ishizaki T. Altered protein binding of disopyramide in plasma from patients with cancer and with inflammatory disease. Therapeutic drug monitoring, 9(3)272-8, 1997.
[22] กลุ่มงานเภสัชกรรม โรงพยาบาลราชวิถี. เอกสารแนะนำผู้ป่วย. กรุงเทพมหานคร:โรงพยาบาลราชวิถี, 2547.
[23] Susan Budavari. The Merck index: an encyclopedia of chemicals, drugs, and biological, 11th Edition. Rahway N.J. U.S.A.: Merck & Co., 1989.
[24] อรุณี เดชาพันธุ์กุล, มนัญยา ชาครานนท์, สลิล ชัยวิริยะวงศ์และ ภัทรพิมพ์ สรรพวีรวงศ์. การรักษามะเร็งเต้านมโดยใช้ยาต้านฮอร์โมน. สงขลานครินทร์เวชสาร, 29 (3):127-142, 2554. [Online]. Available: https://medinfo.psu.ac.th/smj2/29_3/04-arunee.pdfhttps://medinfo.psu.ac.th/smj2/29_3/04-arunee.pdf [Accessed: July. 29, 2017].
[25] เภสัชกร ศิวัสว์ ผุลลาภิวัฒน์. หาหมอ.คอม
[26] สริน ทัดทอง. ฮีทช็อคโปรตีน 90 เป้าหมายในการรักษามะเร็ง Heat Shock Protein 90: Target for Cancer Therapy. Thai Pharmaceutical and Health Science Journal – วารสารไทยเภสัชศาสตร์และวิทยาการสุขภาพ, 11(4), 2016.
[27] AMA, Drug Evaluations Annual: 311, 1994.
[28] เอื้อมแข สุขประเสริฐ. CANCER THERAPY. หน่วยมะเร็งวิทยา ภาควิชาอายุรศาสตร์ คณะแพทย์ศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น. การประชุมเชิงปฏิบัติการและการฝึกอบรมเทคนิคการผสมยาเคมีบำบัดที่ให้ทางหลอดเลือดสำหรับเภสัชกรสาขาโรคมะเร็ง ประจำปี 2554 Workshop and Traineeship for Oncology Pharmacy Practitioners 2011. 21-25 กุมภาพันธ์ 2554. กรุงเทพมหานคร: 25-39, 2554.