การประเมินจุลินทรีย์และแร่ธาตุบางชนิดบริเวณรอบรากตองกง (Thysanolaena latifolia) จากอำเภอแม่สอด จังหวัดตาก ประเทศไทย
คำสำคัญ:
ตำแหน่ง V3-4, เทคโนโลยีการหาลำดับเบส, จุลินทรีย์, พื้นที่สูง, ตองกงบทคัดย่อ
การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาประชากรจุลินทรีย์และแร่ธาตุในดินรอบรากต้นตองกง (Thysanolaena latifolia) จากพื้นที่รกร้างในอำเภอแม่สอด จังหวัดตาก ประเทศไทย จำนวน 3 พื้นที่ ได้แก่ ดินในพื้นที่ 1 เป็นตัวอย่างดินที่เก็บจากพื้นที่ที่เคยปลูกข้าวโพดเลี้ยงสัตว์ ดินบริเวณพื้นที่ 2 เป็นพื้นที่ที่ยังไม่เคยใช้ประโยชน์ในการเกษตร พื้นที่ 3 เป็นตัวอย่างดินจากพื้นที่ที่เคยปลูกกะหล่ำปลี สำหรับการวิเคราะห์กลุ่มประชากรจุลินทรีย์ด้วย HiSeq 2500 System ของ Illumina เพื่อดำเนินการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของแบคทีเรียที่ตำแหน่ง V3-V4 ของยีน 16S rRNA นอกจากนี้ยังมีการวัดค่า pH ความชื้นในดิน อุณหภูมิ การนำไฟฟ้า อัตราส่วนคาร์บอน (C)/ไนโตรเจน (N) โพแทสเซียม (K) ฟอสฟอรัส (P) กำมะถัน (S) อะลูมิเนียม (Al) แมงกานีส (Mn) นิกเกิล (Ni) ทองแดง (Cu ) เหล็ก (Fe) และสังกะสี (Zn) จากผลการทดลอง หน่วยอนุกรมวิธานเชิงปฏิบัติการ (OTU) ของจุลินทรีย์ในพื้นที่ที่ 1, 2 และ 3 เท่ากับ 4,226, 3,937 และ 2,958 ตามลำดับ OTU ที่เหมือนกันทั้ง 3 พื้นที่เท่ากับ 1,684 โดยกลุ่มแบคทีเรียในระดับไฟลัม "Proteobacteria" มีอยู่มากในพื้นที่ที่ 2 และ 3 ในทางตรงกันข้าม "Acidobacteriota", "Planctomycetota" และ "Verrucomicrobiota" มีอยู่สูงในพื้นที่ที่ 1 แต่ "Candidatus Thermoplasmatota" มีอยู่มากมายในพื้นที่ที่ 2 นอกจากนี้ Methylobacillus และ Pseudarthrobacter พบมากในพื้นที่ที่ 2 แต่ Sphingomonas สูงในพื้นที่ที่ 3 ค่า pH ความชื้นในดิน อัตราส่วน C/N, K, Ni, Cu, Fe และ Zn มีความแตกต่างอย่างเป็นนัยสำคัญทางสถิติระหว่าง 3 กลุ่ม ผลลัพธ์ที่ได้นี้เป็นข้อมูลสำคัญที่จะเพิ่มองค์ความรู้ด้านจุลินทรีย์และแร่ธาตุในดินรอบรากต้นตองกงในพื้นที่รกร้าง กลุ่มแบคทีเรียที่เด่นและแร่ธาตุในดินอาจขึ้นอยู่กับลักษณะของพื้นที่ที่แตกต่างกัน นอกจากนี้ข้อมูลดังกล่าวจะช่วยสนับสนุนการกลับมาฟื้นฟูการใช้ประโยชน์ในอนาคต
Downloads
เอกสารอ้างอิง
Schoch, C. L., Ciufo, S., Domrachev, M., Hotton, C. L., Kannan, S., Khovanskaya, R., Leipe, D., Mcveigh, R., O'Neill, K., Robbertse, B., Sharma, S., Soussov, V., Sullivan, J. P., Sun, L., Turner, S., and Karsch-Mizrachi, I. (2020). NCBI Taxonomy: A comprehensive update on curation, resources and tools. Database, 2020, Article baaa062. https://doi.org/10.1093/database/baaa062
Christenhusz, M. J. M., and Byng, J. W. (2016). The number of known plants species in the world and its annual increase. Phytotaxa, 261(3), 201-217. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.261.3.1
Noltie, H. J. (2000). Flora of Bhutan. Royal Botanic Gardens: Edinburgh.
Niveditha, T., and Balarama, P. (2016). Thysanolaena latifolia (Roxb. ex Hornem.) Honda as natural resource and product for the tribals of Srikakulam District, Andhra Pradesh, India. Indian Journal of Natural Products and Resources, 7(2), 181-184.
Bisht, N. S., and Ahlawat, S. P. (1998). Broom grass. State Forest Research Institute, Department of Environment & Forests, Government of Arunachal Pradesh.
Choudhary, V. K., Pant, P., Babu, C. R., and Mazumdar-Leighton, S. (2018). Bacterial typing of diverse rhizospheric communities of the Ravine broom grass Thysanolaena latifolia (Roxb. ex Hornem.) Honda., fam. Poaceae., associated with iron ore mines. In V. Ramana (Chairs), International Symposium on Host–Pathogen Interaction [Symposium]. 59th International Annual Conference of The Association of Microbiologists of India, Hyderabad, India.
Wippel, K., Tao, K., Niu, Y., Zgadzaj, R., Kiel, N., Guan, R., Dahms, E., Zhang, P., Jensen, D. B., Logemann, E., Radutoiu, S., Schulze-Lefert, P., and Garrido-Oter, R. (2021). Host preference and invasiveness of commensal bacteria in the Lotus and Arabidopsis root microbiota. Nature Microbiology, 6(9), 1150-1162. https://doi.org/10.1038/s41564-021-00941-9
Finkel, O. M., Salas-González, I., Castrillo, G., Conway, J. M., Law, T. F., Teixeira, P. J. P. L., Wilson, E. D., Fitzpatrick, C. R., Jones, C. D., and Dangl, J. L. (2020). A single bacterial genus maintains root growth in a complex microbiome. Nature, 587(7832), 103-108. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2778-7
Calvaruso, C., Turpault, M. P., and Frey-Klett, P. (2006). Root-associated bacteria contribute to mineral weathering and to mineral nutrition in trees: A budgeting analysis. Applied and Environmental Microbiology, 72(2), 1258-1266. https://doi.org/10.1128/AEM.72.2.1258-1266.2006
Jacoby, R., Peukert, M., Succurro, A., Koprivova, A., and Kopriva, S. (2017). The role of soil microorganisms in plant mineral nutrition-current knowledge and future directions. Frontiers in Plant Science, 8, Article 1617. https://doi.org/10.3389/fpls.2017.01617
Edwards, J., Johnson, C., Santos-Medellín, C., Lurie, E., Podishetty, N. K., Bhatnagar, S., Eisen, J. A., and Sundaresan, V. (2015). Structure, variation, and assembly of the root-associated microbiomes of rice. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112(8), E911-E920. https://doi.org/10.1073/pnas.1414592112
Bulgarelli, D., Garrido-Oter, R., Münch, P. C., Weiman, A., Dröge, J., Pan, Y., McHardy, A. C., and Schulze-Lefert, P. (2015). Structure and function of the bacterial root microbiota in wild and domesticated barley. Cell Host and Microbe, 17(3), 392-403. https://doi.org/10.1016/j.chom.2015.01.011
Norsaengsri, M., Sungkaew, S., Janloy, A., and Teerawatananon, A. (2022). Grasses in Thailand. Pathum Thani: The National Science Museum Thailand Press.
Bhilabutra, W., McKenzie, E., Hyde, K., and Lumyong, S. (2010). Mycosphere Fungi on the grasses, Thysanolaena latifolia and Saccharum spontaneum, in northern Thailand. Mycosphere, 5, 301-314.
Apaso, S., Dechomang, S., Junto, N., and Bodeerat, C. (2023). Development of border special economic zones. Journal of Administration and Social Science Review, 6(2), 229-235.
Bray, R. H., and Kurtz, L. T. (1945). Determination of total, organic, and available forms of phosphorus in soil. Soil Science, 59(1), 39-46. https://doi.org/10.1097/00010694-194501000-00006
Spain, A. M., Krumholz, L. R., and Elshahed, M. S. (2009). Abundance, composition, diversity and novelty of soil Proteobacteria. The ISME journal, 3(8), 992-1000. https://doi.org/10.1038/ismej.2009.43
Zhou, Y., Qin, Y., Liu, X., Feng, Z., Zhu, H., and Yao, Q. (2019). Soil bacterial function associated with stylo (Legume) and bahiagrass (Grass) Is affected more strongly by soil chemical property than by bacterial community composition. Frontiers in Microbiology, 10, Article 798. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00798
Macey, M. C., Pratscher, J., Crombie, A., and Murrell, J. C. (2018). Draft genome sequences of obligate Methylotrophs Methylovorus sp. Strain MM2 and Methylobacillus sp. Strain MM3, Isolated from grassland soil. Microbiology Resource Announcements, 7(8), Article e00824-18. https://doi.org/10.1128/MRA.00824-18
Sun, Y., Wang, C., Mi, W., Qu, Z., Mu, W., Wang, J., Zhang, J., and Wang, Q. (2022). Effects of irrigation using activated brackish water on the bacterial community structure of rhizosphere soil. Journal of Soil Science and Plant Nutrition, 22, 4008-4023. https://doi.org/10.1007/s42729-022-01003-7
Kroeksakul, P., Ngamniyom, A., Silprasit, K., Phanom, S., Thayat, S., Phowan, N., and Singhaboot, P. (2023). Evaluation of pesticide and heavy metal contamination on soil properties and microbiota in Thailand’s mountainous region. Journal of Ecological Engineering, 24(7), 331-344. https://doi.org/10.12911/22998993/165957
Jia, Y. -H., Jin, Z. -J., Yuan, W., Cheng, Y. -Y., Qiu, J. -M., Liang, J. -T., Pan, F. -J., and Liu, D. -S. (2019). Comparison of soil bacterial community structure between paddy fields and dry land in the huixian karst wetland, China. Huanjing Kexue, 40(7), 3313-3323.
https://doi.org/10.13227/j.hjkx.201811048
Ofek, M., Hadar, Y., and Minz, D. (2012). Ecology of root colonizing Massilia (Oxalobacteraceae). PLoS One, 7(7), Article e40117. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0040117
Zhang, S. -Y., Xiao, W., Xia, Y. -S., Wang, Y. -X., Cui, X. -L., and Zhang, N. -M. (2015). Arenimonas taoyuanensis sp. nov., a novel bacterium isolated from rice-field soil in China. Antonie Van Leeuwenhoek, 107(5), 1181-1187. https://doi.org/10.1007/s10482-015-0409-3
ดาวน์โหลด
เผยแพร่แล้ว
รูปแบบการอ้างอิง
ฉบับ
ประเภทบทความ
สัญญาอนุญาต
ลิขสิทธิ์ (c) 2025 วารสารมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ สาขาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
อนุญาตภายใต้เงื่อนไข Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
วารสารมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ สาขาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี อยู่ภายใต้การอนุญาต Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 International (CC-BY-NC-ND 4.0) เว้นแต่จะระบุไว้เป็นอย่างอื่น โปรดอ่านหน้านโยบายของวารสารสำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับการเข้าถึงแบบเปิด ลิขสิทธิ์ และการอนุญาต
